Как я понимаю, "these" здесь означает эти 5 субдоменов. Соответственно, речь идет о С- и N-конце (относительно этих доменов):

Аминотерминальный фрагмент из 23 аминокислот содержит ревертазную активность. Карбокситерминальный фрагмент (относительно этих субдоменов) является доменом рибонуклеазы Н.

А после 23 просто пропущено (из экономии) слово "residues":

... peptide corresponding to the amino- terminal 23 residues of the HIV glycoprotein...
...in their amino terminal 23 residues
...chains were compared over their amino-terminal 23 residues...
и т.д.